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公開日:2024年3月11日
更新日:2024年3月11日

会社売却における税金の基礎知識

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引退を検討していたり、経営方針の見直し等、様々な理由で会社売却をしたい経営者は多いのではないでしょうか。会社を売却する際には税金がかかりますが、会社売却の方法や売り手が法人か個人かによってかかる税金が異なります。会社を売却するにあたって、税金はできる限り節約したいと考える方も多いでしょう。

そこで今回は、株式譲渡や事業譲渡による会社売却を検討している経営者や経営陣に向けて、会社売却における税金の基礎知識を解説します。また、節税の方法や注意点、専門家を活用するメリットについてもご紹介します。

会社売却における税金の種類

会社を売却する場合、税金の種類は、株式譲渡による場合と事業譲渡による場合とで異なります。また、売り手が個人の場合と法人の場合で税金の種類に違いがあります。

会社売却における税金の種類

株式譲渡

主体が個人株主

所得税・復興特別所得税・住民税

主体が法人株主

法人税・地方法人税・法人住民税・法人事業税・特別法人事業税

事業譲渡

主体が個人

所得税・復興特別所得税・住民税・消費税

主体が法人

法人税・地方法人税・法人住民税・法人事業税・特別法人事業税・消費税

なお、所得税、法人税等の課税対象となるのは譲渡による利益です。つまり、株式譲渡であれば譲渡価格から株式の取得費用や取引手数料を差し引いた金額、事業譲渡であれば個人の場合は資産の種類ごとの譲渡利益に、法人の場合は譲渡価格から譲渡資産・負債の差額を差し引いた金額に対し課税が行われます。

譲渡価格自体が課税の対象となるわけではありません。
一方、消費税は事業譲渡における譲渡資産のうち、課税される資産の額に対して課されます。

株式譲渡による会社売却の税金

株式譲渡による会社売却の税金について、売却する株主が個人の場合と法人の場合に分けて見ていきましょう。

売り手が個人の場合に係る税金


個人が売却した株式の譲渡所得に対しては分離課税により税金がかかります。つまり、他の所得と合計せずに、株式の譲渡所得単独で税額を算出します。事業所得や給与所得といった他の所得にかかる税金とは仕組みが異なることを覚えておきましょう。

個人株主による株式の譲渡所得に対してかかる税金は下記の通りです。

・所得税

・復興特別所得税

・住民税

以下、それぞれ解説していきます。

所得税と住民税の税率

所得税は、譲渡所得に対して15%の税率が課されます。これに加えて、復興特別所得税も2037年分までかかります。税率は所得税額に対し2.1%となっています。つまり、譲渡所得税と復興特別所得税を合わせて15.315%が課税されます。

住民税は、譲渡所得に対して5%の税率が課されます。

所得税、復興特別所得税と住民税あわせて20.315%の税率で課税されます。売却する株式が上場株式か非上場株式かにかかわらず上記税率で計算されます。

なお、譲渡した株式の取得費用がわからなかったり、実際の取得費用が譲渡価格の5%相当額を下回る場合には、譲渡価格の5%相当額を取得費用として譲渡所得を計算することができます。

税金のシミュレーション

株式の譲渡価格が3億円、株式取得費用が3,000万円、取引手数料が2,000万円の場合にかかる税金を計算してみましょう。

譲渡所得額

3億円(譲渡価格)3,000万円(株式取得費用)2,000万円(取引手数料)25,000万円

所得税の金額

25,000万円(譲渡所得額)×15.315%3,8287,500

住民税の金額

25,000万円(譲渡所得額)×5%1,250万円

税金の合計

3,8287,500円+1,250万円=5,0787,500

税金の申告・納税のタイミング

個人が払う税金の額は、通常、毎年216日から315日の間に行う確定申告によって決定されます。前年11日~1231日までの収入や支出を計算し、申告する必要があります。

納税のタイミングは所得税と住民税で異なります。所得税及び復興特別所得税は315日までに確定申告を行い納税しますが、住民税は6月に居住している自治体から住民税決定通知書が届き、6月、8月、10月、翌年1月のそれぞれ末日までを納期限として4回に分けて納めます(お勤めの方が特別徴収を選択する場合は、給与から毎月天引きされます)。

3月に所得税等を納税した後、住民税を納税するまでに期間があるため、資金を使ってしまって住民税の納税ができないということがないようにお金は残しておく必要があります。

売り手が法人の場合にかかる税金

売り手が法人の場合、譲渡益に対して法人税が課されます。

個人の場合とは異なり、法人税は譲渡益以外の損益も合算したうえで税額を計算することになります。

以下で法人税等の税率の解説と課される税金のシュミレーションを行います。

法人税等

法人税等は、法人税、地方法人税、法人住民税、法人事業税、特別法人事業税で構成され、それらの負担を合算した割合である実効税率は約34%です。

税金のシミュレーション

株式の譲渡価格が3億円、株式取得費用が3,000万円、取引手数料が2,000万円、税率が34%の場合にかかる法人税を計算してみましょう。

なお、譲渡益以外の損益は考慮しないものとします。

譲渡所得額

3億円(譲渡価格)3,000万円(株式取得費用)2,000万円(取引手数料)25,000万円

法人税の金額

25,000万円(譲渡所得額)×34%=8,500万円

申告・納税のタイミング

法人は、会社が定める事業年度が終了した翌日から2ヶ月以内に法人税の申告をする必要があります。例えば、会計年度の終わりが3月末なら、申告期限は5月末になります。

法人税を納税するタイミングは、申告期限同様事業年度終了の翌日から2ヶ月以内です。会計年度の終わりが3月末なら、納税期限は5月末になります。

なお、定款の定めにより事業年度終了の日の翌日から2か月以内に定時株主総会が招集されない常況にあるケースや、会計監査人を置いているなど一定の場合には、「申告期限の延長の特例」の適用を受けて、納税の期限を延ばすこともできます。ただし、この場合でも納付期限は延長されないことに注意が必要です。申告期限の延長に合わせて一か月納付を遅らせた場合、一カ月分の利子税がかかります。その他、災害などやむを得ない理由により申告及び納付期限が延長される場合もあります。

事業譲渡による会社売却の税金

事業譲渡は基本的に法人間で行われますが、売り手が個人事業主の場合と、法人の場合に分けて解説します。

売り手が個人の場合にかかる税金

所得税や住民税

個人事業主が事業を売却した場合、譲渡した資産の種類に応じて異なる所得区分により所得税や住民税が計算されます。

例えば、土地や建物の譲渡であれば分離課税の譲渡所得、棚卸資産及びこれに準ずる資産(取得価額が10万円未満の少額減価償却資産など)の譲渡であれば事業所得、営業権やその他の資産は総合課税の譲渡所得、といった形でそれぞれ個別資産の譲渡として処理することになります。

消費税

株式譲渡の場合、「消費」という性質を伴わない取引のため消費税がかかりませんが、事業譲渡は事業用資産の売買取引なので消費税がかかります。

ただし、資産によっては消費税がかからないものもあります。たとえば、営業権は課税対象ですが、土地や生活用資産、売掛金などについては消費税がかかりません。

例えば店舗兼住宅のように、事業と日常生活の両方のために使用している資産は、事業用の部分について課税の対象となります。

なお、消費税は売却時に買い手から受け取るため、実質的な負担はありません。

売り手が法人の場合にかかる税金

事業譲渡によって、売り手の法人が負担する税金は以下の通りです。

法人税

譲渡金額が譲渡する資産と負債の差額よりも上回った場合、つまり利益が発生した場合、その利益に対して法人税が課税されます。

法人税の税率は、株式譲渡の場合と同様、約34%です。

消費税

売り手が個人の場合と同様、譲渡する資産の中で消費税の課税対象となる資産にだけ課されます。 消費税の税率は10%です。

納税するのは売り手である法人ですが、実質負担は買い手になります。

税金のシミュレーション

事業の譲渡価格が1億円、譲渡対象事業の純資産が5,000万円、法人税の税率が34%、消費税の課税対象の資産が1,000万円の場合にかかる税金を計算してみましょう。

法人税の課税対象額

1億円(譲渡価格)5,000万円(譲渡対象事業の純資産)5,000万円

法人税の金額

5,000万円×34%1,700万円

消費税の金額

1,000万円×10%=100万円

税金の合計額

1,700万円+100万円=1,800万円

会社売却における節税対策

役員退職慰労金を活用する

役員退職慰労金を活用することで、税金を節約することができます。

譲渡価格の一部を役員退職慰労金として受け取ることで、譲渡所得を減少させ、節税につなげることが可能です。退職慰労金にかかる所得税率は、一定の金額の範囲内であれば、株式譲渡や事業譲渡の所得税や法人税率よりも低いため、その差分が税負担の軽減につながります。

具体的な役員退職慰労金にかかる所得税の計算方法は以下の通りです。源泉徴収前の退職金額から、勤続年数に応じて計算される控除額を差し引いた金額に二分の一を乗じた退職所得金額(役員等勤続年数が5年以下である人がその役員勤続年数に対応する退職手当等として支払を受けるものは二分の一計算の適用はありません)に、所得税率を乗じて所得税が計算されます。

(退職金額-退職所得控除額)× 1/2 × 税率-控除額

退職所得控除額の計算方法

勤続年数(=A

退職所得控除額

20年以下

40万円×A

80万円に満たない場合には、80万円)

20年超

800万円+70万円×A20年)

所得税

課税される所得金額

税率

控除額

1,000 から 1,949,000円まで

5

0

1,950,000 から 3,299,000円まで

10

97,500

3,300,000 から 6,949,000円まで

20

427,500

6,950,000 から 8,999,000円まで

23

636,000

9,000,000 から 17,999,000円まで

33

1,536,000

18,000,000 から 39,999,000円まで

40

2,796,000

40,000,000 以上

45

4,796,000

このほかに、所得税額に2.1%を乗じた復興特別所得税、退職所得金額に10%を乗じた住民税が課されます。

ただし、退職所得は上記の通り課税対象額が大きくなるほど税率も上がる累進課税により税金が計算されるため、あまりにも高い金額を得てしまうとかえって税負担が増えてしまうことにもつながるので注意が必要です。また、不相当に高額な役員退職金は損金として認められないリスクもありますから、専門家に相談して適正額を検討し、税金のシミュレーションを行うのがよいでしょう。

会社売却で税金に関するトラブル

税務リスク

会社売却の際の税金のトラブルとして、もっとも考えられるのは、税務リスクです。

特に株式譲渡における契約では、契約上、過去の税務処理について売却後に追徴課税が発生した場合、売り手が負担することとされるのが一般的です。

税務リスクに適切に対処するために、過去の税務処理の妥当性を確かめたり、節税を考えるときには、専門家に相談することをおすすめします。

税金の滞納

会社売却での税金に関する別のトラブルの一つとして、税金の滞納が挙げられます。

税金の支払いは、個人の場合も法人の場合も確定申告後になります。株式譲渡もしくは事業譲渡を行ってから納税までの期間に資金を使ってしまい納税するための資金が残っていないという事態が発生しないように、資金繰りには十分注意しましょう。

個人の場合、所得税は確定申告と同時期に支払いとなりますが、住民税は支払いがさらに数ヶ月先となるため、問題なく支払えるように資金を手元に残しておきましょう。

期限を過ぎても税金を支払わないでいると当然、滞納とみなされてしまいますので、税金をしっかり支払えるように準備をしておきましょう。

会社売却時の専門家の活用メリット

会社売却は、税金や法律などの専門知識が必要な複雑なプロセスを経て実行するものです。

専門家を活用することで、会社売却に関するリスクを最小限に抑えることができます。専門家には、会計士、税理士、弁護士、M&Aアドバイザーなどが含まれます。

ただ、専門家に依頼するには費用がかかるため、事前に見積もりを取り、最適な依頼先を見つけることが重要です。

以下で、専門家を活用するメリットをいくつか解説します。

専門知識を持つプロフェッショナルのアドバイスを受けられる

専門家は、会社売却に関する専門知識を持っているため、会社売却に関するリスクを最小限に抑えるためのアドバイスが得られます。

例えば、税理士からは売却によって生じる様々な税金の負担を減らすための方法をアドバイスしてもらえるでしょう。また、M&Aアドバイザーに依頼をすることで、最適な買い手を見つけるための助言ももらえます。

会社売却のプロセスをスムーズに進めることができる

会社売却には、多くの手続きが必要です。手続きを全て自分で行うのは非常に労力がかかるうえ、売却先の選定や節税方法を間違えてしまい会社売却に失敗してしまうというリスクもあります。

専門家から、会社売却のプロセスをスムーズに進めるためのアドバイスを受けることができます。また、会社売却に必要な書類作成や交渉などを代行することもできます。

例えば、M&Aアドバイザーに依頼すれば最適な売却先を探してくれるでしょう。

専門家に依頼することで、プロセスがスムーズに進むだけでなく、会社売却が成功する可能性が高まるのです。

会社売却に関する情報を機密に保つことができる

会社売却には、多くの機密情報が含まれます。例えば、会社の財務諸表や、事業計画、顧客との取引情報、契約内容などです。そういった情報の漏洩が起きることで、取引先や顧客へ不信感を与えてしまったり、場合によっては秘密保持契約に違反する可能性もあります。

また、従業員へ適切なタイミングで情報を開示できないと、思わぬ不安を抱かせてしまうといったリスクも孕んでいます。

M&Aの専門家に相談することで、会社売却に関する情報を適切に管理して、機密に保ちながらプロセスを進めてくれます。

会社売却における税金の支払いと計画

会社を売却すると税金が発生します。税金を滞りなく支払えるように、支払時期を把握し、支払の計画を立てておくことが重要です。

会社売却における税金の支払いタイミングは個人の場合と法人の場合で異なります。具体的には以下の通りです。

個人の税金の支払い

既述のとおり、個人事業主の確定申告期間は、毎年216日から315日にかけてです。

前年11日から1231日までの収入や支出を計算し、申告することで、個人が払う税金の額が決定されます。確定申告の期限は315日までとなっています。

期限までにきちんと申告するようにしましょう。

法人の税金の支払い

法人は、会計年度が終了した翌日から2ヶ月以内に納税する必要があります。

会社の会計年度の終わりが近づいてきたら、納税期限までに滞りなく支払いができるように、早めに準備を始めましょう。

まとめ

今回は、会社売却の際にかかる税金について、株式譲渡と事業譲渡の場合に分けて詳しく解説しました。

節税対策についてもご紹介しましたが、税に関する法律や制度は複雑です。方法や手順を誤ると思わぬトラブルにつながりかねません。

会社売却および会社売却時の節税対策は、専門家の助けを借りて行うようにしましょう。

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